Les mostres que arriben de les prospeccions dels focus larvaris, convenientment retolades amb el codi de cada un d'ells seran analitzades en el laboratori.
Amb l'ajut de la lupa o el microscopi òptic seran classificades les larves de les diferents espècies de mosquits, determinant alhora el seu desenvolupament larvari. Aquest element és fonamental per al seu posterior tractament.
S'ha de fer esment que no totes les espècies es mostren agressives per a l'home, per tant no totes seran objecte de control.
Aquestes dades complementaran la fitxa de prospecció realitzada sobre el terreny i passaran a nodrir la base de dades específica que gestiona el funcionament general del servei any rere any.
En funció de l'espècie present i del seu grau de desenvolupament larvari es procedirà al seu control.
Al laboratori també es realitzen tasques d'identificació dels mosquits adults capturats en el programa anual de control d'adults, que en definitiva ens mostren l'evolució de la plaga al llarg de l'any.
També es realitzen petits treballs interns o bé en col•laboració amb d'altres organismes, sempre relacionats amb els insectes i la caracterització físico-química dels nostres focus larvaris.
Al llarg de la campanya s'analitzen més de 10.000 exemplars de mosquits tant a nivell larvari com d'adult.
